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菜心響應(yīng)高溫脅迫的轉(zhuǎn)錄組分析與基因挖掘

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摘要:【目的】探索菜心響應(yīng)高溫脅迫的轉(zhuǎn)錄組分析及基因挖掘,為篩選響應(yīng)高溫脅迫的菜心耐熱基因及耐熱菜 心分子育種提供參考依據(jù)。【方法】以菜心耐熱品種四九-19號(hào)和熱敏品種特青遲心4號(hào)2個(gè)耐熱性差異明顯的菜心品 種為試驗(yàn)材料,經(jīng)高溫(42℃)脅迫處理后,對(duì)植株地上部和地下部共24個(gè)樣本基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選出差異表 達(dá)基因(DEGs),利用COG、GO、KEGG、KOG、Pfam、Swiss-Prot、eggNOG和Nr生物數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)DEGs進(jìn)行功能注釋,篩 選響應(yīng)高溫脅迫的熱激轉(zhuǎn)錄因子和熱激蛋白,同時(shí)利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證重要基因表達(dá)情況,并分析其啟動(dòng)子 區(qū)順式作用元件。(剩余32633字)

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