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基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的菜心莖尖組織開花相關(guān)基因差異表達(dá)分析

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摘要:【目的】基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析鑒定調(diào)控菜心抽薹開花相關(guān)的候選基因及信號(hào)通路,為今后闡明菜心抽薹 開花調(diào)控分子機(jī)制及選育不同熟性菜心品種提供理論參考?!痉椒ā繉?duì)四九-19號(hào)(早熟型)和80天油綠(晚熟型)菜心的 七葉期和現(xiàn)蕾期莖尖組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,比較不同熟性菜心品種間及不同生長(zhǎng)時(shí)期間的差異表達(dá)基因(DEGs),并對(duì) 其進(jìn)行GO功能注釋及KEGG信號(hào)通路富集分析,結(jié)合FLOR-ID和UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)篩選出不同熟性菜心參與調(diào)控抽薹開花時(shí)間的候選基因及信號(hào)通路,通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的可靠性。(剩余27236字)

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