天子藍盤麗魚皮膚組織的單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

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摘要：【目的】通過單細胞轉(zhuǎn)錄組測序比較天子藍盤麗魚和野生阿蓮卡盤麗魚皮膚組織中與體色形成相關的基因 表達模式，為深入研究魚類體色及良種選育提供數(shù)據(jù)基礎，也為盤麗魚或其他水產(chǎn)魚類進行單細胞轉(zhuǎn)錄組研究提供 技術借鑒?！痉椒ā坷脝渭毎D(zhuǎn)錄組測序技術對天子藍（人工選育）和阿蓮卡（野生型）2種盤麗魚的皮膚組織進行轉(zhuǎn) 錄組測序，經(jīng)fastp質(zhì)控過濾后，通過Cell Ranger比對參考基因組生成單細胞表達矩陣文件，使用Seurat進行降維聚類 后構建轉(zhuǎn)錄組圖譜，篩選出細胞類型識別與鑒定的標記基因；同時以阿蓮卡盤麗魚為對照，通過DEGseq篩選出2個樣本間的差異表達基因（DEGs），并進行GO功能注釋分析和KEGG信號通路富集分析。（剩余23176字）