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伊麗莎白安格斯三角梅轉(zhuǎn)錄組的SSR、SNP和InDel特征分析

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摘要:【目的】基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析伊麗莎白安格斯三角梅SSR、SNP和InDel位點(diǎn)特征,為開發(fā)三角梅分子標(biāo) 記、選育無刺或少刺品種、品種鑒定及親緣關(guān)系分析提供理論依據(jù)?!痉椒ā恳砸聋惿装哺袼谷敲?個(gè)時(shí)期的枝刺 和莖段為材料,對(duì)其進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,采用Trinity對(duì)獲得的高質(zhì)量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行序列組裝,利用MISA和GATK3對(duì) SSR、SNP和InDel進(jìn)行特征分析。(剩余22130字)

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