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摘要:【目的】對(duì)劍白香豬黑色和白色表皮組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選出對(duì)黑色素生成起調(diào)節(jié)作用的miRNA,為進(jìn)一步研究miRNA對(duì)劍白香豬表皮顏色形成的調(diào)控機(jī)制提供理論依據(jù)?!痉椒ā恳詣Π紫阖i黑色和白色表皮組織為 試驗(yàn)材料進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,以|logFold Change|≥1且錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(FDR)<0.05為標(biāo)準(zhǔn),采用DESeq2篩選差異表達(dá) miRNA,使用miRanda和RNAhybrid預(yù)測(cè)差異表達(dá)miRNA靶基因并進(jìn)行GO功能注釋和KEGG信號(hào)通路富集分析,構(gòu) 建差異表達(dá)miRNA、靶基因和KEGG信號(hào)通路互作網(wǎng)絡(luò),利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR對(duì)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。(剩余24280字)
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基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的劍白香豬表皮顏色相關(guān)miRNA篩選與鑒定
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