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猴樟CbMYB308轉(zhuǎn)錄因子基因克隆及生物信息學(xué)分析

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摘要 為研究猴樟CbMYB308蛋白的序列結(jié)構(gòu)和功能,該文克隆猴樟CbMYB308基因CDS序列,進行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,克隆得到的序列具有1個942 bp完整的ORF框,編碼313個氨基酸,與沉水樟中收錄的RWR91885.1基因序列一致性達97.29%,系統(tǒng)進化樹的結(jié)果表明,猴樟CbMYB308蛋白具有較高的保守性;猴樟CbMYB308蛋白生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,CbMYB308蛋白具有PLN03091家族結(jié)構(gòu)域,為R2R3-MYB型轉(zhuǎn)錄因子,CbMYB308蛋白化學(xué)分子式為C1496H2356N432O489S11,相對分子量34.57 kDa,理論等電點6.12,結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定,無序化特征明顯,為脂溶性和親水性蛋白,磷酸化氨基酸位點有53個,亞細胞定位預(yù)測為細胞核。(剩余4827字)

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