不同單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增體系擴(kuò)增牛微量血液DNA效果評(píng)價(jià)

打開文本圖片集

摘 要：  旨在通過二代測(cè)序技術(shù)評(píng)估不同單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增（single cell whole genome amplification， scWGA）體系對(duì)牛微量血液基因組DNA的擴(kuò)增效果，建立微量DNA全基因組擴(kuò)增體系。本研究分別采用MDA（multiple displacement amplification）和MALBAC（multiple annealing and looping-based amplification cycles）兩種scWGA體系對(duì)華西牛1 ng血液基因組DNA進(jìn)行全基因組擴(kuò)增，隨后基于兩種體系的擴(kuò)增產(chǎn)物以及原始未稀釋血液DNA構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)，利用DNBSEQ-T7RS測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行全基因組測(cè)序（whole genome sequencing，WGS），通過比較擴(kuò)增產(chǎn)物片段大小、濃度、總質(zhì)量評(píng)估擴(kuò)增效率，通過分析GC含量、測(cè)序覆蓋度、基因分型一致率、基因型檢出率等評(píng)估兩種體系的擴(kuò)增效果。（剩余18648字）