基于全基因組重測序數(shù)據(jù)的新疆褐牛基因組結(jié)構(gòu)變異檢測及群體結(jié)構(gòu)分析

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摘 要： 旨在鑒定新疆褐牛基因組結(jié)構(gòu)變異（structure variation，SVs）特征，并在此基礎(chǔ)上探索新疆褐牛培育過程中受到影響的結(jié)構(gòu)變異。本研究基于全基因組重測序數(shù)據(jù)，利用Manta、Delly、Lumpy三款軟件對新疆褐牛及其父母本（瑞士褐牛、哈薩克牛）以及中國西門塔爾?；蚪M結(jié)構(gòu)變異進(jìn)行檢測，之后利用主成分分析、構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹和遺傳分化指數(shù)（FST）將新疆褐?；蚪M與其余3個品種進(jìn)行比較分析。（剩余18164字）