小麥IQM 基因家族鑒定及非生物脅迫下表達分析

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摘要：IQM 基因是鈣調(diào)素結(jié)合蛋白家族中的重要分支，在植物生長發(fā)育和應(yīng)激反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。本研究利用生物信息學(xué)方法在小麥全基因組中鑒定出23個IQM 基因家族成員，對其染色體位置、理化性質(zhì)、系統(tǒng)進化關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)、蛋白保守結(jié)構(gòu)域、啟動子順式作用元件和基因表達特性等進行了系統(tǒng)分析。結(jié)果表明，TaIQM 基因家族成員隨機分布在小麥18條染色體上，亞細胞定位結(jié)果顯示所有基因均位于細胞核中，系統(tǒng)進化分析將其分為3個亞類，同一亞類間基因結(jié)構(gòu)、蛋白保守結(jié)構(gòu)域相似度較高，推測其功能相似；順式作用元件分析表明，TaIQM 基因家族成員啟動子中含有多種與逆境脅迫及生長發(fā)育相關(guān)順式作用元件；轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析顯示，TaIQM 基因家族成員在不同時期的根、莖、葉、穗和籽粒中表達量存在顯著性差異；qRT-PCR分析顯示，在小麥苗期地上部和地下部，TaIQM 基因響應(yīng)干旱、低溫、高溫、NaCl、ABA等多種脅迫，顯示上調(diào)或下調(diào)表達。（剩余13765字）