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中華絨螯蟹在低溫脅迫下的轉(zhuǎn)錄組SNP位點(diǎn)識(shí)別及其功能分析

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摘要:為深入探究低溫環(huán)境對(duì)中華絨螯蟹(Eriocheir sinensis)轉(zhuǎn)錄組的影響,特別關(guān)注SNP標(biāo)記位點(diǎn)及其關(guān)聯(lián)基因SNP-Unigene在低溫脅迫條件下的作用。選擇在低溫環(huán)境和原產(chǎn)地條件下飼養(yǎng)的中華絨螯蟹作為研究對(duì)象,利用Illumina平臺(tái)對(duì)其肝胰腺進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。使用SOAPsnp軟件對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行SNP位點(diǎn)檢測(cè),并對(duì)這些SNP-Unigene進(jìn)行GO、KOG和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì)及功能注釋。(剩余9614字)

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