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菊花腦WRKY基因家族生物信息學(xué)分析及其對低溫脅迫的響應(yīng)特征

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摘要:WRKY作為植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,參與植株生長過程中的各個環(huán)節(jié),響應(yīng)各種脅迫。為了探究菊花腦WRKY基因家族的進(jìn)化和功能,基于已發(fā)表的RNA-Seq數(shù)據(jù)庫分析了CnWRKY在低溫脅迫響應(yīng)中的表達(dá)情況,用Hmmer、NCBI-CDD軟件和Pfam數(shù)據(jù)庫得到目標(biāo)基因,再用TBtools軟件分析蛋白質(zhì)的理化性質(zhì),繪制進(jìn)化樹,用MEME、PlantCARE分析該轉(zhuǎn)錄因子的保守基序、順式作用元件。(剩余11779字)

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