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板栗葉綠體基因組密碼子使用偏好性分析

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摘要:為明確板栗葉綠體基因組密碼子使用偏好性及其形成原因,利用CodonW與EMBOSS軟件對從板栗葉綠體基因組密碼子中篩選出來的52條蛋白編碼序列進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,板栗葉綠體基因組密碼子中同義密碼子相對使用頻率超過1的有31個,并且多以A或U結(jié)尾,表明板栗葉綠體基因組偏好使用以A或U結(jié)尾的密碼子;板栗葉綠體基因組蛋白編碼序列的有效密碼子數(shù)平均值為48.04(大于35),說明板栗葉綠體基因組密碼子使用偏好性較弱。(剩余8919字)

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