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煙草DUF538基因家族鑒定及根結(jié)線蟲脅迫下表達(dá)分析

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摘要:DUF538基因是沒有功能注釋的蛋白,在根結(jié)線蟲脅迫的響應(yīng)過程中,含有DUF538結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)的基因表達(dá)發(fā)生變化。鑒定煙草DUF538基因家族,為煙草DUF538基因功能研究提供理論依據(jù),有利于篩選防御根結(jié)線蟲的有效基因?;跓煵萑蚪M數(shù)據(jù),通過BLAST對煙草DUF538基因家族進(jìn)行鑒定,利用生物信息學(xué)的方法分析了該家族成員的理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域、染色體分布、系統(tǒng)進(jìn)化及啟動子,并利用qRT-PCR驗(yàn)證了DUF538基因家族在K326各個組織的表達(dá)情況及響應(yīng)南方根結(jié)線蟲侵染的表達(dá)情況。(剩余12730字)

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