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山羊原癌基因c-fos電子克隆與生物信息學(xué)分析

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摘要:為探明山羊原癌基因c-fos的結(jié)構(gòu)與功能,以牛c-fos基因編碼序列(GenBank登錄號(hào)為AY322482)作為種子序列電子克隆了山羊c-fos基因cDNA序列,并利用生物信息學(xué)方法對(duì)其完整編碼序列的蛋白理化特征、二級(jí)結(jié)構(gòu)、親/疏水性進(jìn)行全面解析,進(jìn)一步預(yù)測(cè)了該基因在山羊染色體上的定位。結(jié)果表明,山羊c-fos基因cDNA全長(zhǎng) 1 513 bp,開放閱讀框?yàn)? 143 bp,共編碼380個(gè)氨基酸,G+C含量高于A+T;山羊c-fos基因編碼蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)主要以無(wú)規(guī)則卷曲為主,其他為α-螺旋,延伸直鏈較少,屬于一種親水性、酸性不穩(wěn)定蛋白;山羊與同屬反芻動(dòng)物的綿羊、牛和馬鹿c-fos基因核苷酸序列相似性為95.4%~99.5%;c-fos基因可能定位于山羊10號(hào)染色體上。(剩余9125字)

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