鯽魚血液、肝臟、卵巢組織轉(zhuǎn)錄組比較分析

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摘要：為進(jìn)一步豐富鯽魚基因組數(shù)據(jù)，對肝臟、血液和卵巢組織進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)錄組測序。采用Illumina Hiseq高通量測序平臺進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序，對所獲得序列進(jìn)行比對、基因注釋、差異表達(dá)和SNP、SSR分析。結(jié)果提示，組裝得到 127 801 條unigene，平均長度為735 bp。與相應(yīng)數(shù)據(jù)庫比對，最終獲得117 414（91.87%）個(gè)有注釋信息的unigene，有105條unigene獲得GO注釋，并分類到生物學(xué)過程、細(xì)胞組分和分子功能三大類42個(gè)功能中;有20 725條unigene被歸納到KOG的26個(gè)直系同源功能類型;獲得KEGG注釋的unigene共參與五大類32小類代謝通路。（剩余12813字）