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紫芽六堡茶轉(zhuǎn)錄組SSR位點(diǎn)序列分析

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摘要:以廣西梧州紫芽六堡茶為研究對(duì)象,運(yùn)用MISA軟件對(duì)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的165 570 條unigene序列(總長(zhǎng)度為240 177 233 bp),進(jìn)行SSR位點(diǎn)搜索。使用Excel軟件對(duì)SSR位點(diǎn)的出現(xiàn)頻率、基元類型、基元組成、平均距離等進(jìn)行處理分析。結(jié)果表明,共在10 058 條unigene中找到符合條件的SSR位點(diǎn)11 482個(gè),出現(xiàn)頻率為6.93%,平均距離為20.92 kb,平均長(zhǎng)度為20.80 bp。(剩余7864字)

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