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茶樹NUDIX 基因家族的鑒定及表達(dá)分析

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摘要:NUDIX 水解酶屬于焦磷酸酶,在信息傳遞、植物生長(zhǎng)協(xié)調(diào)和響應(yīng)逆境脅迫等方面起著重要作用?;诓铇洌–amellia sinensis)基因組鑒定出43 個(gè)NUDIX 家族基因,并運(yùn)用生物信息學(xué)和實(shí)時(shí)熒光定量PCR 等方法對(duì)其分析。結(jié)果表明,43 個(gè)CsNUDXs 蛋白質(zhì)分子量介于11.8~89.2 kDa,氨基酸長(zhǎng)度為102~342 個(gè),理論等電點(diǎn)為4.49~9.26,18.6%的蛋白為穩(wěn)定性蛋白;根據(jù)進(jìn)化關(guān)系將CsNUDXs 分為6 個(gè)亞家族;啟動(dòng)子順式作用元件分析發(fā)現(xiàn)CsNUDXs 具有許多與激素響應(yīng)、逆境脅迫和生長(zhǎng)發(fā)育等調(diào)控相關(guān)的作用元件;對(duì)CsNUDXs家族基因在不同器官表達(dá)模式進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)CsNUDX3、CsNUDX7 在果實(shí)中表達(dá)量較高,而CsNUDX22、CsNUDX25 在果實(shí)中表達(dá)量極低,CsNUDX30 在老葉中表達(dá)量極低;不同處理組的實(shí)時(shí)熒光定量PCR 結(jié)果表明,1 mmol·L-1 茉莉酸甲酯(MeJA)處理下CsNUDX1、CsNUDX2 和CsNUDX33 等表達(dá)量呈現(xiàn)先升后降再升的趨勢(shì),而1 mmol·L-1 水楊酸(SA)處理下CsNUDX4、CsNUDX12 和CsNUDX22 等表達(dá)量則呈現(xiàn)先降后升再降的趨勢(shì),300 mmol·L-1 NaCl 處理下CsNUDX2、CsNUDX4 和CsNUDX22 等表達(dá)量呈現(xiàn)先升后降的趨勢(shì)。(剩余15252字)

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