菠蘿葉綠體基因組密碼子偏好性分析

打開文本圖片集

摘  要：葉綠體基因組密碼子偏好性影響基因的表達(dá)效率，對于葉綠體基因工程應(yīng)用及物種遺傳改良具有重要的科學(xué)意義。為了明確菠蘿葉綠體基因組密碼子偏好性的使用特征及主要影響因素，本研究以菠蘿葉綠體基因組為研究對象，利用生物信息學(xué)軟件分析其密碼子的使用模式和偏好性。密碼子偏好性相關(guān)參數(shù)分析顯示：（1）菠蘿葉綠體基因密碼子的GC含量平均值為38.31%，密碼子第1～3位的GC含量平均值分別為46.78%、39.61%、28.53%，密碼子前兩位的GC平均含量明顯高于第3位;（2）有效密碼子數(shù)（ENC）的取值范圍為38.48～61.00，平均值為47.21，其密碼子偏性較弱。（剩余15173字）