3種貴州地方雞盲腸菌群結(jié)構(gòu)特征的比較

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摘要：【目的】基于微生物16S rRNA測序技術(shù)探究3種貴州地方雞的盲腸菌群結(jié)構(gòu)特征，鑒別不同品種雞盲腸富集的特定菌群，從腸道菌群角度解析地方雞遺傳資源特性，進(jìn)而加深對貴州地方雞腸道菌群特征的認(rèn)識?！痉椒ā窟x取3種貴州地方雞（烏蒙烏骨雞11羽、黔東南小香雞12羽及瑤山雞12羽），采集盲腸內(nèi)容物樣品檢測16S rRNA序列V3～V4可變區(qū)，通過QIIME計(jì)算雞盲腸菌群Alpha多樣性，以主坐標(biāo)分析（PCoA）評估雞盲腸菌群Beta多樣性；采用SparCC算法構(gòu)建盲腸菌群互作網(wǎng)絡(luò)，使用馬修斯相關(guān)系數(shù)（MCC）算法進(jìn)行樞紐菌群識別，并以LEfse分析鑒別組間差異的菌群類別及功能通路。（剩余28308字）