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新型阿卡斑病毒SYBR Green I熒光定量RT-PCR建立及廣西邊境地區(qū)蚊攜帶新型阿卡斑病毒調(diào)查

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摘要:【目的】建立檢測新型阿卡斑病毒(AKAV)的SYBR Green I熒光定量RT-PCR,并結(jié)合序列測定開展廣西邊境地區(qū)蚊攜帶新型AKAV調(diào)查,了解其流行趨勢及遺傳進(jìn)化特征,為建立重要蚊媒病毒病預(yù)警機(jī)制提供技術(shù)支持。【方法】分別針對新型AKAV的S基因和M基因主要變異位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物,建立SYBR Green I熒光定量RT-PCR并通過Ct值、標(biāo)準(zhǔn)曲線斜率、相關(guān)系數(shù)、擴(kuò)增效率及擴(kuò)增準(zhǔn)確性等指標(biāo)確定最佳反應(yīng)體系及擴(kuò)增程序;以優(yōu)化的SYBR Green I熒光定量RT-PCR檢測2019年6—10月在廣西邊境地區(qū)采集的139份蚊樣品,獲得的新型AKAV經(jīng)測序后采用ClustalW構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹。(剩余18059字)

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