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摘 要:研究通過(guò)Sanger測(cè)序法對(duì)天然雌核發(fā)育的縮骨鯽(Carassius auratus var. Suogu)線粒體DNA的Cyt b基因和控制區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增和測(cè)序,并與已發(fā)表的其他鯽屬魚(yú)類(lèi)的Cyt b基因進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,探討縮骨鯽與其他鯽屬魚(yú)類(lèi)的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果表明:縮骨鯽線粒體DNA中Cyt b基因和控制區(qū)全序列分別長(zhǎng)1 141和924 bp;其中,Cyt b基因的堿基含量為29.1%(T)、27.9%(C)、28.7%(A)和14.3%(G),控制區(qū)序列的堿基含量為32.6%(T)、20.7%(C)、32.6%(A) 和14.1%(G);2種序列中G+C含量均明顯低于A+T含量,且G含量偏低,顯示了與其他脊椎動(dòng)物線粒體核苷酸堿基含量相似的特征;控制區(qū)序列可以分為終止序列區(qū)、中央保守區(qū)和保守序列區(qū)3個(gè)區(qū)域,均識(shí)別到了對(duì)應(yīng)的保守序列;基于鄰接法(NJ)和最大簡(jiǎn)約法(MP)構(gòu)建縮骨鯽與其他鯽屬魚(yú)類(lèi)Cyt b 基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)表明,縮骨鯽與紅鯽和淇河鯽的親緣關(guān)系最近,而縮骨鯽與野鯽、淇河鯽和紅鯽分布在同一個(gè)姐妹支系,進(jìn)一步說(shuō)明縮骨鯽可能起源于野鯽,是野鯽的一個(gè)地方種群。(剩余8738字)
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縮骨鯽Cyt b基因和控制區(qū)序列克隆及系統(tǒng)進(jìn)化分析
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