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雙自編碼結合變分貝葉斯的單細胞RNA-Seq聚類

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摘 要:近年來單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術的快速發(fā)展使得在單個細胞水平上研究組織器官的異質性成為可能。針對單細胞RNA測序數(shù)據(jù)中準確鑒定細胞類型問題,提出一種新的基于雙自編碼結合變分貝葉斯高斯混合模型的聚類方法,稱之為sc-VBDAE。首先通過對抗自編碼網絡的編碼和解碼過程重構數(shù)據(jù),然后使用經典自編碼對數(shù)據(jù)進行降維,獲得低維且有效的數(shù)據(jù)。(剩余16327字)

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