黃牛源產(chǎn)氣莢膜梭菌分離株基因組的生物信息學(xué)分析

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摘 要：本研究自猝死海南黃牛的組織器官中分離到2株A型產(chǎn)氣莢膜梭菌，命名為ZWCP209和ZWCP210。基因組拼接結(jié)果顯示其基因組大小處于3.4～3.5Mb之間，tRNA和CDS數(shù)量穩(wěn)定。多位點(diǎn)序列分析（MLST）顯示，測(cè)序菌株屬于同種新ST型。從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取27株牛源產(chǎn)氣莢膜梭菌的基因組，與測(cè)序分離株共同進(jìn)行生物信息學(xué)分析：共檢測(cè)到13種耐藥基因，其中四環(huán)素類(lèi)耐藥基因tetA（P）和tetB（P）的攜帶率最高（79.4%），值得關(guān)注的是，本研究中2株海南黃牛分離株均攜帶了7種以上的耐藥基因，其中包括非獸用抗生素唑烷酮的耐藥基因optrA。（剩余13291字）