產(chǎn)靈菌紅素沙雷氏菌R18的鑒定及基因組特性

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摘要：采用形態(tài)學(xué)、生理生化和分子生物學(xué)方法對(duì)菌株R18進(jìn)行菌種鑒定。通過(guò)基因組測(cè)序和生物信息學(xué)比較，進(jìn)一步分析其分類(lèi)地位和生物學(xué)特性，并在基因組水平上探討該菌株紅色素的合成基因簇和代謝路徑。結(jié)果表明：菌株R18最佳生長(zhǎng)條件為溫度30～37 ℃，pH值6～8，NaCl質(zhì)量濃度0～10 g·L-1；菌株R18與粘質(zhì)沙雷氏菌模式菌株ATCC 13880的16S rDNA相似度為99.86%，基因組平均核苷酸均一性和數(shù)字DNA-DNA雜交值分別為98.73%，89.5%，均高于物種界定閾值，屬于同一個(gè)物種；菌株R18靈菌紅素合成基因簇全長(zhǎng)35 021 bp，包含29個(gè)基因，其中，4個(gè)核心合成基因、10個(gè)補(bǔ)充的合成基因、1個(gè)調(diào)控基因、1個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)基因及13個(gè)其他基因，具有完整的靈菌紅素合成代謝途徑。（剩余17096字）