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雞胚胎期肌內(nèi)脂肪形成lncRNA相關(guān)ceRNA網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

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摘要:目的 篩選雞胚胎期肌肉差異表達(dá)長鏈非編碼RNA(lncRNA)、微小RNA(miRNA)及mRNA,通過構(gòu)建lncRNA-miRNA-mRNA競爭性調(diào)控網(wǎng)絡(luò),挖掘肌內(nèi)脂肪形成的重要候選基因。方法 分別采集玫瑰冠雞、科寶雞胚胎期的肌肉組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,利用生物信息學(xué)方法篩選差異表達(dá)lncRNA、miRNA和mRNA,對差異表達(dá)基因GO富集及KEGG信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑分析,同時(shí)預(yù)測lncRNA-miRNA、miRNA-mRNA之間的靶標(biāo)關(guān)系,結(jié)合基因表達(dá)分析,構(gòu)建可能與肌內(nèi)脂肪形成相關(guān)的lncRNA-miRNA-mRNA競爭性調(diào)控網(wǎng)絡(luò),利用qRT-PCR驗(yàn)證測序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。(剩余11959字)

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