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基于生物信息學(xué)分析胰島素分泌細(xì)胞誘導(dǎo)過程中miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

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摘要:目的  探討人胚胎干細(xì)胞(hESCs)向胰島素分泌細(xì)胞(IPCs)誘導(dǎo)分化過程中基因表達(dá)的差異,并構(gòu)建miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。方法  從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的GSE42094數(shù)據(jù)集篩選差異表達(dá)基因,對(duì)其進(jìn)行GO功能和KEGG路徑顯著性分析。選用miRTarBase數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)其靶miRNA,應(yīng)用cytoscape 9.1.0 軟件構(gòu)建miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)并可視化,采用文獻(xiàn)數(shù)據(jù)驗(yàn)證預(yù)測(cè)的miRNA。(剩余11560字)

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