紅花SPL基因家族全基因組鑒定及表達(dá)分析

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摘要：SPL基因家族是植物特有的轉(zhuǎn)錄因子，廣泛參與調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育，包括花和果實(shí)的發(fā)育、脅迫響應(yīng)和次生代謝物的合成等。為探究紅花SPL基因家族的進(jìn)化和功能，本研究基于紅花基因組數(shù)據(jù)庫篩選得到21個(gè)SPL基因，利用生物信息學(xué)方法對(duì)其進(jìn)行分析。結(jié)果表明，紅花SPL基因家族鑒定得到的21個(gè)成員聚類為6個(gè)亞家族，同一個(gè)亞家族成員具有相似的基因結(jié)構(gòu)和基序，大多數(shù)CtSPL蛋白具有1個(gè)完整保守的SBP結(jié)構(gòu)域;CtSPL基因啟動(dòng)子區(qū)域存在光反應(yīng)元件，激素應(yīng)答元件、脅迫響應(yīng)元件以及和植物生長(zhǎng)發(fā)育有關(guān)的調(diào)控元件;miRNA靶位點(diǎn)預(yù)測(cè)表明有15個(gè)CtSPL基因受miR156家族的調(diào)控;表達(dá)模式分析表明，CtSPL基因呈現(xiàn)組織特異性表達(dá)。（剩余12791字）