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癌癥中甲基化改變對增強(qiáng)子活性的影響

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[摘要]目的分析識別癌癥中甲基化改變對增強(qiáng)子活性的影響。方法分別從人類增強(qiáng)子數(shù)據(jù)庫FANTOM5、甲基化DNA結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫MeDReaders及分子特征數(shù)據(jù)庫MSigDB中獲取增強(qiáng)子、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)及分子通路數(shù)據(jù)等信息,識別受甲基化影響的活性增強(qiáng)子、正常與癌癥差異甲基化增強(qiáng)子和探針,并在CpG Island上注釋,根據(jù)增強(qiáng)子和基因的共表達(dá)情況進(jìn)一步識別增強(qiáng)子甲基化調(diào)控的靶基因并在泛癌模塊中進(jìn)行功能富集分析,最后進(jìn)行COX比例風(fēng)險回歸分析與功能分析模式的識別。(剩余10795字)

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