一株褐家鼠戊型肝炎病毒的發(fā)現(xiàn)鑒定及系統(tǒng)發(fā)生分析

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摘 要：對云南省大理市小型哺乳動物攜帶的戊型肝炎病毒（HEV）進行調(diào)查，用巢式RT-PCR對捕獲的小型哺乳動物樣品中的病毒進行檢測，用高通量測序?qū)﹃栃訦EV樣本進行毒株全基因組測序，用MEGA-X、BESTv1.10.4 和Geneious軟件進行生物信息學分析。本研究篩查了6屬7種共114只小型哺乳動物樣本，結(jié)果顯示：HEV在褐家鼠中的陽性率為8.00%（2/25）；高通量測序獲得1株編號為DL147的HEV全基因組，經(jīng)系統(tǒng)發(fā)生分析確定其為HEV-C1基因型，與香港1例戊型肝炎患者血清中發(fā)現(xiàn)的HEV同源性最高，核苷酸序列一致性達95.21%，兩株病毒的最早分歧時間約為2003年。（剩余12749字）