基于4D label-free 技術的水稻成熟種子蛋白質(zhì)組學研究

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摘要： 【目的】從蛋白水平揭示水稻種子成熟的分子基礎，探究調(diào)控水稻種子成熟的關鍵蛋白和代謝通路?！痉椒ā窟x用授粉后30 d 的成熟水稻種子，利用4D label-free 定量蛋白質(zhì)組學進行質(zhì)譜鑒定，通過生物信息學技術分析蛋白的亞細胞定位、結(jié)構(gòu)域、GO 注釋和KEGG 通路注釋?！窘Y(jié)果】總共鑒定了3 484 個種子成熟期的蛋白，相對分子質(zhì)量大多在10 000～100 000 之間，主要分布于細胞質(zhì)、細胞核、葉綠體、線粒體和質(zhì)膜上；結(jié)構(gòu)域主要涉及蛋白質(zhì)翻譯的RNA 識別基序和蛋白磷酸化修飾的蛋白激酶結(jié)構(gòu)域；GO 分析表明，成熟種子的蛋白主要參與了細胞過程和代謝過程，主要涉及催化活性和結(jié)合等功能，大多分布在細胞、細胞組分、細胞器和細胞膜等部位；KEGG 分析發(fā)現(xiàn)，蛋白主要富集在核糖體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的蛋白質(zhì)加工、氧化磷酸化和糖酵解等途徑，推測蛋白質(zhì)的翻譯、加工和能量代謝是水稻種子成熟期的主要分子事件；進一步鑒定了脫落酸（Abscisic acid，ABA） 信號和吲哚乙酸（Indoleacetic acid，IAA） 代謝的相關蛋白，同時也發(fā)現(xiàn)了NAC（NAM、ATAF1/2 和 CUC2） 家族的轉(zhuǎn)錄因子。（剩余5925字）