基于人類蛋白質(zhì)組微陣列數(shù)據(jù)篩選蟾毒靈抗癌作用靶點的生物信息學分析
打開文本圖片集
[摘要] 目的
通過生物信息學方法分析蟾毒靈人類蛋白質(zhì)組微陣列數(shù)據(jù),探究蟾毒靈互作蛋白之間的潛在聯(lián)系,預測蟾毒靈在癌癥中的作用靶點。
方法 使用clusterProfiler包進行GO、KEGG和GSEA富集分析,使用STRING數(shù)據(jù)庫及Cytoscape軟件進行關(guān)鍵蛋白篩選。下載TCGA數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)進行關(guān)鍵基因的泛癌分析;使用survival包繪制關(guān)鍵基因在肺癌、肝癌和胃癌中的K-M曲線,評估其預后效能。(剩余15957字)