基于單細胞測序探究去勢抵抗性前列腺癌腫瘤微環(huán)境及細胞間通訊相關信號分子

打開文本圖片集

［摘要］目的：探究去勢抵抗性前列腺癌（castration-resistant prostate cancer，CRPC）的腫瘤微環(huán)境中相關信號分子，并分析其與腫瘤發(fā)生發(fā)展之間的關系。方法：通過基因表達綜合數(shù)據(jù)庫（Gene Expression Omnibus，GEO）中CRPC患者的單細胞RNA測序（scRNA-seq）數(shù)據(jù)（GSE137829），分析CRPC腫瘤微環(huán)境的主要組成成分；通過CellPhoneDB分析微環(huán)境中不同細胞間的相互作用，重點揭示腫瘤相關成纖維細胞（cancer-associated fibroblasts，CAFs）與惡性上皮細胞之間的聯(lián)系；應用CellChat分析CAFs與惡性上皮細胞通訊相關的信號分子，結合腫瘤基因組圖譜前列腺癌（TCGA-PRAD）的數(shù)據(jù)，尋找與CRPC患者預后密切相關的信號分子。（剩余18170字）