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[摘要] 目的: 通過生物信息學(xué)分析,篩選出腸易激綜合征(irritable bowel syndrome,IBS)免疫浸潤下的潛在染色質(zhì)調(diào)控因子(chromatin regulators,CRs),并闡述其與免疫細胞、免疫功能之間的聯(lián)系。方法: 整合CRs文件和IBS基因表達矩陣,進行加權(quán)基因共表達分析和差異性分析,取其交集CRs;基于交集CRs,進行蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析并構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)圖;利用基因表達矩陣進行免疫浸潤的提取和量化,分析免疫細胞之間和免疫功能之間的相關(guān)性和差異性,并與PPI網(wǎng)絡(luò)圖中的CRs進行相關(guān)性分析;構(gòu)建風(fēng)險模型,分析與免疫浸潤密切相關(guān)的CRs的風(fēng)險概率,從而篩選出潛在的CRs。(剩余18441字)
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基于生物信息學(xué)篩選腸易激綜合征免疫浸潤下的染色質(zhì)調(diào)節(jié)因子
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