江西鉛山紅芽芋TIFY 9基因克隆與功能分析

打開文本圖片集

摘要：為了深入探究江西鉛山紅芽芋TIFY 9基因的功能，通過江西鉛山紅芽芋試管苗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫篩選到江西鉛山紅芽芋TIFY 9基因的核心片段，利用RT-PCR 技術(shù)克隆該基因，并采用生物信息學(xué)方法、轉(zhuǎn)基因瞬時表達(dá)和實(shí)時定量 PCR進(jìn)行序列分析、亞細(xì)胞定位、器官表達(dá)分析和功能分析。結(jié)果表明：江西鉛山紅芽芋TIFY 9基因cDNA總長度為522 bp，G+C 含量為58.62%;由174個氨基酸組成，分子量19 073.87 u，等電點(diǎn)9.30，為親水性蛋白;二級結(jié)構(gòu)由α-螺旋（31.61%）、β-片層（12.64%）、無規(guī)則卷曲（55.75%） 構(gòu)成，三級結(jié)構(gòu)為單體;主要存在細(xì)胞核中;在進(jìn)化上與Colocasia esculenta（芋）的親緣關(guān)系較近，與Colocasia esculenta（芋）hypothetical protein Taro_030839（MQL98131.1）在進(jìn)化上具有最高的親緣關(guān)系。（剩余11551字）