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基于滇黃精轉錄組序列的SSR標記開發(fā)及其在黃精屬資源分析中的應用

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摘要:本研究基于滇黃精轉錄組序列開發(fā)簡單重復序列(SSR)標記并將其應用于黃精屬資源分析。設計合成了45對SSR引物,經(jīng)PCR擴增驗證,選擇其中20對SSR引物對75份黃精屬資源進行分析。結果表明,共在46 416個Unigene中檢出含有二核苷酸~六核苷酸重復類型的SSR位點60 238個,序列SSR發(fā)生頻率為22.78%,平均分布距離約7.07 kb;SSR位點中的主導類型是二核苷酸和三核苷酸重復,分別占50.06%和34.89%。(剩余15179字)

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