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基于Nanopore測序技術的非洲豬瘟病毒全基因組測序方法建立

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摘 要: 非洲豬瘟(ASF)是由非洲豬瘟病毒(ASFV)引起的一種高度傳染性和致死性疫病,近年來給我國生豬產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展造成了沉重打擊。ASFV龐大的基因組導致人們難以及時掌握流行毒株的全基因組序列。本研究旨在利用Nanopore三代測序技術建立一種簡便可靠的ASFV全基因組測序方法。設計覆蓋ASFV全基因組的31對引物并分為4個引物池對樣本進行擴增,通過Nanopore測序技術對擴增產(chǎn)物進行測序,進一步優(yōu)化相關生物信息學分析方法,最終成功建立了ASFV 全基因組測序方法。(剩余16447字)

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