工業(yè)大麻WRKY家族全基因組鑒定及生物信息學(xué)分析
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摘要:WRKY轉(zhuǎn)錄因子是一類具有多種生物學(xué)功能的基因,工業(yè)大麻中WRKY家族研究較少。本研究使用擬南芥WRKY家族蛋白序列與工業(yè)大麻全基因組進行比對,鑒定到34個WRKY家族成員,不均等分布于9條染色體上,同時可分為GroupⅠ、GroupⅡa~GroupⅡe、GroupⅢ共7個亞族,其中GroupⅠ亞族成員數(shù)量最多,數(shù)量為11個;CsWRKY15包含的結(jié)構(gòu)域最多、CsWRKY34啟動子區(qū)域的順式作用元件最多,二者可能行使著較多生物學(xué)功能;工業(yè)大麻WRKY家族與擬南芥、水稻、玉米、大豆及大麻自身間共線性分析顯示,CsWRKYs存在豐富的直系同源基因進化關(guān)系。(剩余16004字)