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銅綠假單胞菌生物被膜基因表達(dá)生物信息學(xué)研究

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摘要:目的    通過生物信息學(xué)探究銅綠假單胞菌生物被膜形成的差異表達(dá)基因及可能作用機(jī)制。方法    通過GEO數(shù)據(jù)庫(kù)篩選獲得銅綠假單胞菌生物被膜數(shù)據(jù)芯片GSE120760, GEO2R工具篩選出銅綠假單胞菌浮游狀態(tài)和生物被膜狀態(tài)的差異表達(dá)基因;差異表達(dá)基因通過String數(shù)據(jù)庫(kù)和Cytoscape3.7.1軟件中構(gòu)建靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)圖, 并在DAVID和KOBAS數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO生物富集和KEGG通路分析。(剩余12171字)

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