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肝細(xì)胞癌預(yù)后、診斷和免疫細(xì)胞浸潤(rùn)相關(guān)關(guān)鍵基因及其潛在治療藥物的生物信息學(xué)分析

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[摘 要] 目的:利用生物信息學(xué)分析方法篩選與肝細(xì)胞癌 (HCC) 患者預(yù)后、診斷和免疫細(xì)胞浸潤(rùn)相關(guān)的關(guān)鍵基因,并分析其潛在治療藥物。方法:從基因表達(dá)匯編(GEO)數(shù)據(jù)庫(kù)和癌癥基因組圖譜(TCGA) 數(shù)據(jù)庫(kù)下載HCC 基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)及相應(yīng)的HCC 患者臨床信息。采用R 軟件limma 包篩選HCC 差異表達(dá)基因(DEGs),對(duì)DEGs 進(jìn)行基因本體論(GO) 功能和京都基因與基因組百科全書(shū)(KEGG) 信號(hào)通路富集分析,利用STRING 數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建蛋白-蛋白互作(PPI) 網(wǎng)絡(luò),使用 Cytoscape軟件對(duì)PPI 網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行可視化并篩選關(guān)鍵基因。(剩余16615字)

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