基于幽門螺桿菌hp0169 基因三維結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)分析

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［摘 要］ 目的：克隆幽門螺桿菌 （Hp） hp0169基因并進(jìn)行晶體學(xué)研究，分析其二級(jí)結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)。方法：由UniProt數(shù)據(jù)庫中檢索Hp NCTC26695菌株hp0169基因及其編碼蛋白序列，采用生物信息學(xué)方法分析Hp 重組膠原蛋白酶（HpPrtC） 蛋白理化性質(zhì)，SOPMA 和DNAStrar 軟件預(yù)測(cè)HpPrtC蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)特征， SWISS-MOPEL 軟件構(gòu)建HpPrtC 蛋白三維結(jié)構(gòu)， IEDB 和ABCpred 軟件預(yù)測(cè)HpPrtC 蛋白B 淋巴細(xì)胞抗原表位，SYFPEITHI 網(wǎng)站預(yù)測(cè)T 淋巴細(xì)胞抗原表位，專家?guī)欤‥P） 算法和隨機(jī)森林（RF） 算法預(yù)測(cè)HpPrtC 蛋白可結(jié)晶性。（剩余11417字）