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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對(duì)接探討益氣活血方治療冠心病的作用機(jī)制

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摘要 目的:通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析益氣活血方治療冠心病的分子作用機(jī)制,并通過(guò)分子對(duì)接進(jìn)行驗(yàn)證。方法:通過(guò)中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(TCMSP)和中藥分子機(jī)制的生物信息學(xué)分析工具數(shù)據(jù)庫(kù)(BATMAN-TCM)進(jìn)行檢索并篩選出益氣活血方中的藥物活性成分及作用靶點(diǎn);在人類基因名片數(shù)據(jù)庫(kù)(GeneCards)、人類孟德?tīng)栠z傳在線數(shù)據(jù)庫(kù)(OMIM)、藥品數(shù)據(jù)與藥物靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)(DrugBank)、治療靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)(TTD)檢索冠心病對(duì)應(yīng)疾病靶點(diǎn);通過(guò)R語(yǔ)言“Venn”插件得到藥物有效活性成分和冠心病的共同靶點(diǎn)基因,應(yīng)用STRING數(shù)據(jù)庫(kù),獲得蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)圖,利用Cytoscape 3.7.2軟件中CytoNCA插件篩選候選核心靶點(diǎn)基因,并逆向獲得相關(guān)有效成分;共同靶點(diǎn)通過(guò)R語(yǔ)言“ClusterProfile”等插件,完成基因本體(GO)與京都基因與基因組百科全書(shū)(KEGG)富集分析;Cytoscape 3.7.2軟件繪制成分-靶點(diǎn)-通路,根據(jù)節(jié)點(diǎn)篩選核心靶點(diǎn)及成分;利用AutodockTool 4軟件對(duì)所篩選的核心靶點(diǎn)及成分進(jìn)行分子對(duì)接。(剩余17580字)

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