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基于單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的拉克羅斯病毒感染神經(jīng)系統(tǒng)細(xì)胞基因表達(dá)差異分析

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摘要:目的  分析受拉克羅斯病毒(LACV)感染的人腦類器官細(xì)胞不同亞群相關(guān)基因表達(dá)差異,揭示不同亞群之間的轉(zhuǎn)錄組特性。方法  選擇GEO數(shù)據(jù)庫中編號為GSE131434的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),包含2個(gè)樣本,1個(gè)為模擬感染COs的作為陰性對照組,1個(gè)為受LACV感染的COs。采用R語言“seurat”包對數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾、歸一化、主成分分析、UMAP聚類分析,尋找COs亞群。(剩余10805字)

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