金釵石斛AP2/ERF基因家族的鑒定和表達(dá)分析

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摘要：對金釵石斛AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子基因家族在全基因組上進(jìn)行鑒定及生物信息學(xué)分析，為進(jìn)一步闡明金釵石斛AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子的功能研究奠定理論基礎(chǔ)。利用BLASTP比對金釵石斛蛋白，并通過在線網(wǎng)站NCBI CDD、InterPro和SMART進(jìn)一步鑒定，共獲得97個金釵石斛AP2/ERF基因，然后通過ProtParam分析金釵石斛AP2/ERF家族蛋白的理化性質(zhì)、親疏水性，使用MEGA11.0軟件構(gòu)建進(jìn)化樹，利用Map Gene Chrome、GSDS、MEME、PlantCARE在線工具分析AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子的基因定位、基因結(jié)構(gòu)和保守基序，并預(yù)測基因上游的順式作用元件，利用TBTools分析并可視化AP2/ERF基因在各部位的表達(dá)情況。（剩余13279字）