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[摘 要] 目的:基于生物信息學(xué)方法分析富含絲氨酸/精氨酸的剪接因子9(SRSF9) 在頭頸部鱗狀細(xì)胞癌(HNSCC) 中的表達(dá)情況、臨床意義以及與腫瘤免疫浸潤的關(guān)系, 并探討其作用機(jī)制。方法:利用癌癥基因圖譜 (TCGA) 數(shù)據(jù)庫、基因表達(dá)綜合 (GEO) 數(shù)據(jù)庫中 GSE30784 和GSE13601 數(shù)據(jù)集、臨床蛋白質(zhì)組學(xué)腫瘤分析聯(lián)盟(CPTAC) 數(shù)據(jù)庫、基因表達(dá)交互分析(GEPIA)數(shù)據(jù)庫和Kaplan-Meier plotter 數(shù)據(jù)庫分析SRSF9 在HNSCC 中的表達(dá)及與患者臨床病理特征和預(yù)后的關(guān)系;利用cBioPortal 數(shù)據(jù)庫分析SRSF9 基因變異情況;應(yīng)用ESTIMATE 算法和腫瘤免疫估計(jì)資源(TIMER) 數(shù)據(jù)庫評估SRSF9 表達(dá)與腫瘤微環(huán)境和腫瘤免疫細(xì)胞浸潤的關(guān)系;利用LinkedOmics 數(shù)據(jù)庫分析SRSF9 在HNSCC 中的共表達(dá)基因及其調(diào)控通路;基于TCGA SpliceSeq 數(shù)據(jù)庫分析HNSCC中SRSF9 調(diào)控的可變剪接事件,并對靶基因進(jìn)行基因本體(GO) 功能富集分析和京都基因與基因組百科全書 (KEGG) 信號通路富集分析。(剩余17502字)
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基于剪接因子SRSF9 在頭頸部鱗狀細(xì)胞癌中的表達(dá)及臨床意義的生物信息學(xué)分析
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