基于COⅠ基因序列的泥鰍、大鱗副泥鰍選育群體雜交子代遺傳多樣性分析

打開文本圖片集

摘 要：為評估泥鰍、大鱗副泥鰍選育群體的遺傳育種潛力，通過聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）擴(kuò)增和一代測序技術(shù)，獲得經(jīng)兩代群體選育的泥鰍自繁（M）、大鱗副泥鰍自繁（P）及其正交（MP）、反交（PM）等4個(gè)子代泥鰍種群的線粒體細(xì)胞色素氧化酶亞基Ⅰ基因COⅠ片段，并分析了其遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示：（1）4種泥鰍的COⅠ基因片段堿基組成相似，均表現(xiàn)為A+T的含量（54.0%～56.2%）高于C+G的含量（43.8%～46.4%）；（2）4種泥鰍COⅠ基因片段的682個(gè)位點(diǎn)中，共檢測到135個(gè)多態(tài)位點(diǎn)（占19.79%），其中128個(gè)為簡約信息位點(diǎn)，7個(gè)為單堿基變異位點(diǎn)，變異均為轉(zhuǎn)換或顛換，未發(fā)現(xiàn)堿基的插入與缺失；（3）M、P、MP、PM各定義15個(gè)單倍型，單倍型多態(tài)性均為1.000±0.024，核苷酸多態(tài)性分別為0.020 66±0.006 48、0.025 80±0.002 31、0.029 61±0.005 62和0.022 30±0.001 94，均具有高單倍型多樣性和高核苷酸多態(tài)性；（4）M、P、MP、PM種內(nèi)遺傳距離分別為0～0.020、0～0.024、0～0.027和0～0.023，種間遺傳距離為0.024～0.180，系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果顯示，MP與M親緣關(guān)系更近，PM與P親緣關(guān)系更近，體現(xiàn)出明顯的偏母系遺傳效應(yīng)。（剩余10379字）