基于加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)和癌癥基因組圖譜臨床數(shù)據(jù)分析并鑒定肝細(xì)胞癌的Hub基因研究

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【摘要】 背景 肝細(xì)胞癌（HCC）是全球常見的癌癥相關(guān)死亡的第三大原因，約占所有原發(fā)性肝癌病例的90%，其復(fù)發(fā)率和死亡率較高，目前發(fā)生的分子機(jī)制仍不清楚。目的 探索HCC潛在的分子機(jī)制，發(fā)掘新的生物標(biāo)志物。方法 從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)下載RNA-seq表達(dá)數(shù)據(jù)和臨床相關(guān)信息，通過(guò)差異基因表達(dá)分析正常肝臟組織與HCC組織的差異基因；對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行富集分析；基于TCGA中HCC的基因表達(dá)數(shù)據(jù)概況，使用WGCNA R包建立共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，進(jìn)行加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（WGCNA），選擇具有臨床意義的模塊，并篩選候選Hub基因；進(jìn)一步分析候選Hub基因在HCC組織和正常肝臟組織顯著差異表達(dá)、與HCC患者總體生存期和無(wú)病生存期是否顯著相關(guān)，最終確定Hub基因；通過(guò)人類蛋白質(zhì)圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)Hub基因蛋白表達(dá)進(jìn)行驗(yàn)證。（剩余16593字）